一、什么是 CellOracleCellOracle 是 2023 年发表于《Nature》的单细胞多组学分析工具由 Samantha Morris 团队研发。核心作用是构建细胞特异性基因调控网络GRN还能模拟转录因子扰动预测基因敲除 / 过表达后的细胞命运分化趋势。二、所需输入数据基础仅需单细胞转录组数据若搭配 scATAC-seq 染色质开放数据可大幅提升调控网络推断的精准度。三、工具使用难点原生本地版流程繁琐、依赖环境复杂极易出现版本冲突与代码报错配置和调试门槛很高。四、平台在线使用入口为适配单细胞分析场景我们平台开放两种进入方式可从细胞注释、亚群合并任务结果跳转使用原轨迹分析入口暂作下线后续将单独上线专属分析工具。五、平台操作步骤筛选目标感兴趣细胞类型导出 h5ad 格式文件作为分析前置文件选取高可变基因自动构建 GRN 基因调控网络选定待敲除目标基因上传上一步生成并精简后的网络文件即可模拟基因扰动解析下游调控基因。这里需要上传一个文件文件来源第二步生成的文件做个删减即可相关结果可视化如下个人感觉比另外两个虚拟基因敲除更加直观欢迎来测试网址链接https://www.ezygene.com/tool/CellOracle